中国早在魏晋南北朝时，就有求那跋陀罗（Gunabhadra）译著《杂阿含经》和河内沙门白法祖译著《佛般泥洹经》等佛经记载了供养佛舍利的内容，在南京、洛阳等地也先后建造了多座供奉佛舍利的阿育王塔；
隋文帝杨坚（公元年7月21日～公元年8月13日）推行佛教普建佛塔使佛舍利在中国的崇奉走向鼎盛，但是当时关于法门寺佛指舍利的描述比较笼统不明，从“方骨”到“或见如玉，光白映彻”，之后才逐渐出现了“形状如小指初骨，长寸二分，内孔方正，外楞亦尔，下平上渐，内外光净……”、“凤翔法门寺塔有佛指骨”、“……护国真身塔，塔内有释迦佛指骨一节”等较确切的“佛指骨舍利”字样；
关于佛指舍利的形制，唐代高僧、佛教南山律宗开山之祖释道宣（公元年4月初8日～公元年10月）著作《集神州三宝感通录》（公元年）记载有：“其舍利，开头如小指初骨，长寸二分，内空方正，外楞亦尔，下平上圆，内外光净。”；
年4月9日，陕西宝鸡法门寺真身宝塔舍利地宫前室石门外出土由僧澈撰文令真所书的《大唐咸通启送岐阳真身志文》碑，记载有：“长一寸二分，上齐下折，高下不等，三面俱平，一面稍高，中有隐痕。色白如雨稍青，细密而泽，髓穴方大，上下俱通。”，其所记佛指舍利的形状与道宣《集神州三宝感通录》相吻合；
年5月5日至12日，法门寺真身宝塔舍利地宫打开期间共出土4枚舍利，除经专家鉴定的真身佛指骨舍利外，还有两枚白玉所制和另一枚高僧的舍利共3枚“影骨”，为了保护“灵骨”而和其放置在一起，法门寺也随着这枚当今世界独一无二、佛教界至高无上的圣物真身佛指骨舍利的出土而成为佛教著名胜地；
由于在历史上，曾经先后有四位皇帝发动过毁佛、灭佛的事件，分别是公元年（唐宪宗元和14年）韩愈写下《谏迎佛骨》之前的北魏太武帝拓跋焘（公元年～公元年3月11日）、北周武帝宇文邕（公元年～公元年6月21日），和韩愈《谏迎佛骨》之后的唐武帝李炎（公元年7月1日～公元年4月22日）、后周世宗柴荣（公元年10月27日～公元年7月27日），史称“三武一宗”，此间在中国的大部分佛骨舍利遭到毁坏，为了避免佛指骨舍利遭到损毁，于是不少僧尼制作了仿佛祖真身灵骨的附属品“隐骨”；
佛指骨舍利“灵骨”之外的3枚为“影骨”，即“灵骨”之影应、应现，以证示“灵骨”之不灭。佛教界认为“影骨”与“灵骨”是不一不异的关系，卓越的佛教领袖、书法家、社会活动家与爱国主义者赵朴初（年11月5日～年5月21日）说：“影骨非一亦非异，了如一月映三江。”；
释迦牟尼佛指骨舍利“灵骨”为左手中指，三面俱平，一面稍高，上齐下折，长40.03毫米、上宽12.11毫米、上腔径13.75毫米、下腔径16.5毫米，重16.2克，为乳黄色，有似骨质的颗粒分泌物，出土时有星星点点的白色霉点附着其上，有裂纹，有蜡质感，当时因液体浸泡千百年骨质发软而不能触摸。
释迦牟尼佛指骨舍利佛指骨舍利“灵骨”被用五重宝函包装：
第五重宝函为盝顶铁函，为铁质，出土时已锈迹斑斑呈深褐色，最初在此重铁函之外还曾包裹着一层丝绸织物，因年代久远而朽坏殆尽，仅可从残片中识别出它原来的材质和纹样；
第四重宝函为鎏金45尊造像盝顶银函，紧套在第五重宝函之内，精美的函身上雕凿有45尊在佛教界地位很高的唐密金刚界成身会曼荼罗造像，是目前全世界发现最早的密宗曼荼罗方坛场；
第三重宝函为雕花檀香木函，以银包角，由于一千多年的尘封而全部朽坏；
第二重宝函为嵌宝石水晶椁，椁顶嵌有各一颗黄、蓝宝石各一颗，椁盖上雕有观音菩萨坐像，由于原件裂痕严重难以修好，目前以复制品替代展出；
第一重宝函为壶门座玉棺，棺盖雕有普贤菩萨像，玉棺之内供奉着释迦牟尼佛真身灵骨舍利放于雕花棺床之上。
佛指骨舍利“影骨”之一被八重宝函包装：
第八重金筐为银棱顶檀香木宝函，呈精致的黑漆正方体，长、宽、高皆为30厘米，通体以极珍贵的檀香木制成，雕花银棱，内壁漆以乌黑发亮的黑漆，函盖上棱为银质斜面，在被发现时已全部朽坏；
第七重金筐为鎏金四天王顶银宝函；
第六重金筐为素面顶银宝函；
第五重金筐为鎏金如来说法顶银宝函；
第四重金筐为六臂观音纯金顶宝函；
第三重金筐为宝钿珍珠装纯金宝函；
第二重宝函为金筐宝钿珍珠装武夫石宝函；
第一重宝函为宝珠顶单檐四门纯金塔，仅毫米高，塔顶飞檐高翘，纯金方台塔座上有一仅11毫米高的小银柱，用以套置佛指舍利。
年8月24日午夜，历经多次损毁又多次重建的法门寺塔再一次在一阵撼天动地的巨响声中轰然倒塌；
年4月3日～5月12日，文物专家在修缮佛塔时，意外发现了佛塔下地宫内的记事碑和物账碑以及包含释迦牟尼佛指骨舍利、铜浮屠、八重宝函、银花双轮十二环锡杖等佛教至高宝物在内的两千多件大唐国宝重器，尤其是四枚“佛指骨舍利”的先后出土被文物工作者依次编号为最高等级的特一、特二、特三、特四号文物，沉睡千年的唐代珍宝重见天日；
年1月18日，八重宝函被列入国家文物局颁发的《首批禁止出国（境）展览文物目录》；
年法门寺地宫被联合国评定为“世界第九大奇迹”；
年5月25日，法门寺作为南北朝至清朝的遗址被列入国务院颁发的《第六批全国重点文物保护单位目录》；
年5月9日上午，释迦牟尼真身指骨舍利被永久安奉在历时3年新建的米世界最高佛塔合十舍利塔的地宫之中，只有逢节假日、重大佛事活动或农历的初一和十五，才可用电动液压升降机通过顶部莲花中心藻井开启装置升至地面一层供人们瞻礼，合十舍利塔造型如同合十的双手，牢牢的将舍利捧在手心。在塔内建有信息化、系统化、智能化的安保设施，构成了保护这枚特一级国宝无坚不摧的壁垒；
年10月11日，宝鸡法门寺荣获中国旅游景区质量等级评定委员会颁发的国家5A级旅游景区称号；
年10月16日，第27届世界佛教徒联谊会在宝鸡法门寺举行；
宝鸡法门寺地宫中所出土的佛指骨舍利是世界上目前发现的独一无二的兼有文献记载和碑文证实的释迦牟尼佛真身舍利，是佛教世界的最高圣物，史载人们熟知的唐代高僧玄奘法师去西天取经时请回了佛骨舍利，并密藏于代州武台山、终南山五台寺、泗州普光寺及凤翔府法门寺等四大名寺，但是代州武台山及终南山五台寺之佛骨舍利被毁于唐武宗会昌5年的灭佛运动中、普光寺在康熙19年（公元年）陷于洪泽湖导致佛指舍利可能也随之沉没，因此在宝鸡法门寺13层宝塔下埋藏了千年唐朝的“迎佛骨于凤翔”佛骨竟然还能存在于宇宙间并能重现于人们眼前，令世界为之震动，法门寺佛祖真身指骨舍利作为中国现存的唯一佛指骨舍利，其宗教价值和文物价值无可估量。
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